| 1. Spieltag | 27.07.2012 | AJ Auxerre | - | Nîmes Olympique | 2:0 | ||||
| 3. Spieltag | 11.08.2012 | AJ Auxerre | - | CS Sedan | 1:0 | ||||
| 15. Spieltag | 24.11.2012 | AJ Auxerre | - | FC Nantes | 0:2 | ||||
| 16. Spieltag | 30.11.2012 | LB Châteauroux | - | AJ Auxerre | 1:1 | ||||
| 17. Spieltag | 11.12.2012 | AJ Auxerre | - | Chamois Niortais | 4:2 | ||||
| 18. Spieltag | 14.12.2012 | Angers SCO | - | AJ Auxerre | 2:1 | ||||
| 24. Spieltag | 08.02.2013 | AJ Auxerre | - | Tours FC | 3:2 | ||||
| 26. Spieltag | 22.02.2013 | AJ Auxerre | - | EA Guingamp | 2:1 | ||||
| 21. Spieltag | 26.02.2013 | CS Sedan | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 27. Spieltag | 01.03.2013 | AC Arles-Avignon | - | AJ Auxerre | 2:1 |  |
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| 28. Spieltag | 08.03.2013 | AJ Auxerre | - | Havre AC | 4:1 | |
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| 29. Spieltag | 16.03.2013 | RC Lens | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 30. Spieltag | 29.03.2013 | AJ Auxerre | - | Dijon FCO | 0:0 | ||||
| 31. Spieltag | 05.04.2013 | Gazélec FC Ajaccio | - | AJ Auxerre | 0:0 | ||||
| 32. Spieltag | 13.04.2013 | AJ Auxerre | - | AS Monaco | 0:2 | ||||
| 33. Spieltag | 20.04.2013 | FC Nantes | - | AJ Auxerre | 1:1 |  |
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| 34. Spieltag | 26.04.2013 | AJ Auxerre | - | LB Châteauroux | 0:0 |
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