| 5. Spieltag | 03.08.2016 | TSV 1883 Bogen | - | FC Pipinsried | 1:1 |  |
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| 7. Spieltag | 13.08.2016 | SV Pullach | - | FC Pipinsried | 2:1 |  |
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| 8. Spieltag | 21.08.2016 | FC Pipinsried | - | TSV 1865 Dachau | 3:1 | ||||
| 3. Spieltag | 24.08.2016 | TSV Kottern-St. Mang | - | FC Pipinsried | 2:3 | ||||
| 9. Spieltag | 27.08.2016 | SV Kirchanschöring | - | FC Pipinsried | 0:2 |  |
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| 10. Spieltag | 04.09.2016 | FC Pipinsried | - | TSV 1896 Rain | 2:0 | ||||
| 11. Spieltag | 10.09.2016 | FC Gundelfingen | - | FC Pipinsried | 2:3 | ||||
| 23. Spieltag | 04.03.2017 | FC Unterföhring | - | FC Pipinsried | 2:1 | ||||
| 24. Spieltag | 12.03.2017 | FC Pipinsried | - | SV Pullach | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 18.03.2017 | TSV 1865 Dachau | - | FC Pipinsried | 2:1 | ||||
| 26. Spieltag | 26.03.2017 | FC Pipinsried | - | SV Kirchanschöring | 1:0 | ||||
| 28. Spieltag | 09.04.2017 | FC Pipinsried | - | FC Gundelfingen | 0:0 |
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