| 23. Spieltag | 21.03.1999 | TSV 1860 München II | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 1:1 | ||||
| 24. Spieltag | 27.03.1999 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Karlsruher SC II | 2:1 |  |
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| 25. Spieltag | 04.04.1999 | FSV Frankfurt | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 3:1 | |
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| 26. Spieltag | 10.04.1999 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | SC Weismain | 1:0 | ||||
| 27. Spieltag | 17.04.1999 | VfR Mannheim | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 0:0 | ||||
| 28. Spieltag | 24.04.1999 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | SC Neukirchen | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 02.05.1999 | TSF Ditzingen | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 08.05.1999 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Kickers Offenbach | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 12.05.1999 | Bayern München II | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 1:5 | ||||
| 32. Spieltag | 15.05.1999 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | SSV Reutlingen | 0:0 | ||||
| 33. Spieltag | 21.05.1999 | SV Wehen-Taunusstein | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 3:0 |
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