| 1. Spieltag | 08.08.2009 | Fortuna Düsseldorf | - | SC Paderborn 07 | 3:0 | ||||
| 2. Spieltag | 14.08.2009 | SC Paderborn 07 | - | Karlsruher SC | 2:0 | ||||
| 4. Spieltag | 30.08.2009 | SC Paderborn 07 | - | 1. FC Kaiserslautern | 0:0 | ||||
| 15. Spieltag | 06.12.2009 | SC Paderborn 07 | - | MSV Duisburg | 1:3 | ||||
| 20. Spieltag | 31.01.2010 | SC Paderborn 07 | - | FSV Frankfurt | 0:2 | ||||
| 21. Spieltag | 07.02.2010 | 1. FC Kaiserslautern | - | SC Paderborn 07 | 3:0 | ||||
| 26. Spieltag | 14.03.2010 | SC Paderborn 07 | - | Hansa Rostock | 2:2 |  |
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| 27. Spieltag | 20.03.2010 | Arminia Bielefeld | - | SC Paderborn 07 | 3:0 | ||||
| 28. Spieltag | 26.03.2010 | SC Paderborn 07 | - | Rot-Weiß Oberhausen | 1:2 |  |
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| 29. Spieltag | 04.04.2010 | TuS Koblenz | - | SC Paderborn 07 | 2:1 | |
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| 30. Spieltag | 09.04.2010 | SC Paderborn 07 | - | Rot Weiss Ahlen | 2:0 | |
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| 31. Spieltag | 16.04.2010 | SpVgg Greuther Fürth | - | SC Paderborn 07 | 1:1 | |
Deutschland