| 1. Spieltag | 06.08.2011 | Bor. Mönchengladbach II | - | 1. FC Köln II | 3:4 |  |
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| 2. Spieltag | 12.08.2011 | 1. FC Köln II | - | Rot-Weiss Essen | 2:1 | ||||
| 7. Spieltag | 10.09.2011 | Sportfreunde Lotte | - | 1. FC Köln II | 2:0 | ||||
| 8. Spieltag | 17.09.2011 | 1. FC Köln II | - | Eintracht Trier | 0:2 | ||||
| 9. Spieltag | 23.09.2011 | SC Wiedenbrück | - | 1. FC Köln II | 1:2 | |
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| 10. Spieltag | 01.10.2011 | 1. FC Köln II | - | SC 07 Idar-Oberstein | 6:3 | |
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| 11. Spieltag | 16.10.2011 | FC Schalke 04 II | - | 1. FC Köln II | 2:4 | |
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| 12. Spieltag | 22.10.2011 | 1. FC Köln II | - | Borussia Dortmund II | 1:2 |  |
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| 13. Spieltag | 30.10.2011 | Fortuna Düsseldorf II | - | 1. FC Köln II | 1:1 | |
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| 14. Spieltag | 05.11.2011 | 1. FC Köln II | - | Fortuna Köln | 0:0 | ||||
| 19. Spieltag | 12.11.2011 | SC Verl | - | 1. FC Köln II | 1:0 | ||||
| 15. Spieltag | 19.11.2011 | 1. FSV Mainz 05 II | - | 1. FC Köln II | 3:1 | ||||
| 17. Spieltag | 03.12.2011 | 1. FC Köln II | - | SV 07 Elversberg | 1:1 | |
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| 18. Spieltag | 10.12.2011 | TuS Koblenz | - | 1. FC Köln II | 2:2 |
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