| 3. Spieltag | 31.08.2008 | Werder Bremen [B-Junioren] | - | TeBe Berlin [B-Junioren] | 4:2 |  |
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| 21. Spieltag | 07.09.2008 | Werder Bremen [B-Junioren] | - | Concordia Hamburg [B-Junioren] | 5:0 | ||||
| 4. Spieltag | 14.09.2008 | Hannover 96 [B-Junioren] | - | Werder Bremen [B-Junioren] | 5:1 | ||||
| 5. Spieltag | 28.09.2008 | Werder Bremen [B-Junioren] | - | Energie Cottbus [B-Junioren] | 4:0 | |
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| 14. Spieltag | 12.10.2008 | Werder Bremen [B-Junioren] | - | Rot-Weiß Erfurt [B-Junioren] | 6:1 | |
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| 24. Spieltag | 24.05.2009 | Hertha BSC [B-Junioren] | - | Werder Bremen [B-Junioren] | 2:4 | ||||
| 23. Spieltag | 04.06.2009 | Werder Bremen [B-Junioren] | - | Hansa Rostock [B-Junioren] | 2:4 | ||||
| 25. Spieltag | 07.06.2009 | Werder Bremen [B-Junioren] | - | Hamburger SV [B-Junioren] | 2:3 | ||||
| 26. Spieltag | 14.06.2009 | VfL Osnabrück [B-Junioren] | - | Werder Bremen [B-Junioren] | 5:3 |
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