| 6. Spieltag | 03.09.2016 | Bury FC | - | Port Vale FC | 4:1 | ||||
| 8. Spieltag | 17.09.2016 | Swindon Town | - | Bury FC | 1:2 | ||||
| 9. Spieltag | 24.09.2016 | Bury FC | - | Chesterfield FC | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 01.10.2016 | Bury FC | - | Scunthorpe United | 1:2 | ||||
| 12. Spieltag | 08.10.2016 | Peterborough United | - | Bury FC | 3:1 | ||||
| 14. Spieltag | 18.10.2016 | Bury FC | - | AFC Wimbledon | 1:2 | ||||
| 16. Spieltag | 29.10.2016 | Northampton Town | - | Bury FC | 3:2 | ||||
| 17. Spieltag | 12.11.2016 | Bury FC | - | Southend United | 1:4 | ||||
| 22. Spieltag | 17.12.2016 | Bury FC | - | Oxford United | 2:3 | ||||
| 41. Spieltag | 28.03.2017 | Oxford United | - | Bury FC | 5:1 | ||||
| 43. Spieltag | 13.04.2017 | Bury FC | - | Rochdale AFC | 0:1 |
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