# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 16 8 5 3 21:11 10 29
2 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 16 8 4 4 17:8 9 28
3 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 16 8 4 4 11:6 5 28
4 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 16 8 4 4 17:14 3 28
5 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 16 7 6 3 16:7 9 27
6 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 16 7 5 4 15:9 6 26
7 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 16 7 5 4 11:6 5 26
8 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 16 8 2 6 14:10 4 26
9 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 16 7 3 6 9:8 1 24
10 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 16 6 4 6 16:19 -3 22
11 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 16 6 3 7 13:15 -2 21
12 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 16 5 4 7 9:11 -2 19
13 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 16 4 7 5 11:16 -5 19
14 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 16 4 6 6 6:13 -7 18
15 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 16 4 5 7 13:15 -2 17
16 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 16 4 5 7 8:15 -7 17
17 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 16 4 4 8 9:12 -3 16
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 16 3 7 6 8:14 -6 16
19 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 16 3 6 7 8:14 -6 15
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 16 1 7 8 4:13 -9 10
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.

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