# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FK Ekranas, Litauen FK Ekranas 1 1 0 0 4:0 4 3
  FK Kareda Siauliai, Litauen FK Kareda Siauliai 1 1 0 0 4:0 4 3
3 Inkaras Kaunas, Litauen Inkaras Kaunas 1 1 0 0 3:0 3 3
4 FBK Kaunas, Litauen FBK Kaunas 0 0 0 0 0:0 0 0
  FK Banga Gargždai, Litauen FK Banga Gargždai 0 0 0 0 0:0 0 0
  FK Nevėžis, Litauen FK Nevėžis 0 0 0 0 0:0 0 0
  FK Panerys, Litauen FK Panerys 0 0 0 0 0:0 0 0
  FK Zalgiris, Litauen FK Zalgiris 0 0 0 0 0:0 0 0
  FK Žalgiris B, Litauen FK Žalgiris B 0 0 0 0 0:0 0 0
  Kauno Jegeriai, Litauen Kauno Jegeriai 0 0 0 0 0:0 0 0
  Lokomotyvas Kaunas, Litauen Lokomotyvas Kaunas 0 0 0 0 0:0 0 0
12 FK Atlantas, Litauen FK Atlantas 1 0 0 1 0:1 -1 0
  Mastis Telšiai, Litauen Mastis Telšiai 1 0 0 1 0:1 -1 0
14 FK Dainava Alytus, Litauen FK Dainava Alytus 1 0 0 1 1:3 -2 0

# Ekranas - Zalgiris (26.05.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Zalgiris gewertet, wobei Zalgiris die drei Punkte zugesporechen wurden (ursprünglich 1:0 für Ekranas)

# Nach dem 6. Spieltag zog Panerys Vilnius sein Team zurück. Alle Partien wurden annulliert.

# Nach dem 13. Spieltag zog Mastis Telsiai seine Mannschaft zurück. Alle bis dahin gespielten Partien behielten ihre Gültigkeit.

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