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| 18.09.2012 | 14:00 | FK Atlantas | - | VMFD Žalgiris | 3:4 | |
| 16:00 | FK Kruoja Pakruojis | - | FK Šiauliai | 1:0 | ||
| 19.09.2012 | FK Ekranas | - | REO Vilnius | 3:0 Wert. | ||
| 17:30 | FK Sūduva | - | FK Tauras Tauragė | 4:1 | ||
| 20.09.2012 | 17:30 | FK Banga Gargždai | - | FK Dainava Alytus | 5:0 |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FK Ekranas | 29 | 21 | 7 | 1 | 64:21 | 43 | 70 |
| 2 |
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VMFD Žalgiris | 29 | 20 | 6 | 3 | 60:17 | 43 | 66 |
| 3 |
|
FK Sūduva | 29 | 17 | 6 | 6 | 61:32 | 29 | 57 |
| 4 |
|
FK Kruoja Pakruojis | 29 | 16 | 4 | 9 | 42:25 | 17 | 52 |
| 5 |
|
FK Šiauliai | 29 | 14 | 3 | 12 | 63:43 | 20 | 45 |
| 6 |
|
FK Banga Gargždai | 29 | 10 | 7 | 12 | 32:30 | 2 | 37 |
| 7 |
|
FK Dainava Alytus | 29 | 8 | 4 | 17 | 35:56 | -21 | 28 |
| 8 |
|
FK Tauras Tauragė | 29 | 6 | 2 | 21 | 28:74 | -46 | 20 |
| 9 |
|
REO Vilnius | 29 | 5 | 4 | 20 | 26:60 | -34 | 19 |
| 10 |
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FK Atlantas | 29 | 4 | 5 | 20 | 19:72 | -53 | 17 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Abstieg |
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# REO Vilnius zog sich nach dem 24. Spieltag aus finanziellen Gründen aus dem Spielbetrieb zurück. Alle ausstehenden Spiele wurden mit 0:3 gewertet. |
