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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 12 | 10 | 2 | 0 | 35:4 | 31 | 32 |
| 2 |
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Inter Leipzig | 12 | 8 | 3 | 1 | 35:11 | 24 | 27 |
| 3 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 12 | 7 | 2 | 3 | 32:14 | 18 | 23 |
| 4 |
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VFC Plauen | 12 | 6 | 4 | 2 | 30:15 | 15 | 22 |
| 5 |
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SSV Markranstädt | 13 | 6 | 4 | 3 | 22:10 | 12 | 22 |
| 6 |
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Bischofswerdaer FV | 11 | 6 | 3 | 2 | 23:15 | 8 | 21 |
| 7 |
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VfL Halle 96 | 13 | 6 | 3 | 4 | 25:18 | 7 | 21 |
| 8 |
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FSV Barleben | 13 | 6 | 3 | 4 | 23:16 | 7 | 21 |
| 9 |
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Energie Cottbus II | 12 | 6 | 2 | 4 | 32:23 | 9 | 20 |
| 10 |
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SV SCHOTT Jena | 11 | 6 | 1 | 4 | 22:26 | -4 | 19 |
| 11 |
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FC Einheit Rudolstadt | 12 | 5 | 3 | 4 | 16:12 | 4 | 18 |
| 12 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 12 | 4 | 4 | 4 | 22:15 | 7 | 16 |
| 13 |
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Askania Bernburg | 11 | 4 | 2 | 5 | 15:13 | 2 | 14 |
| 14 |
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Union Sandersdorf | 12 | 3 | 4 | 5 | 18:23 | -5 | 13 |
| 15 |
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BSG Wismut Gera | 12 | 3 | 2 | 7 | 14:24 | -10 | 11 |
| 16 |
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FC Eisenach | 12 | 2 | 1 | 9 | 7:35 | -28 | 7 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
