# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 18 10 6 2 20:8 12 36
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 18 9 5 4 23:16 7 32
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 18 8 6 4 18:14 4 30
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 18 7 7 4 16:11 5 28
5 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 18 8 4 6 17:17 0 28
6 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 18 7 6 5 21:15 6 27
7 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 18 7 6 5 19:15 4 27
8 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 18 6 6 6 15:13 2 24
9 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 18 5 8 5 9:8 1 23
10 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 18 5 7 6 16:15 1 22
11 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 18 4 10 4 11:11 0 22
12 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 18 6 3 9 11:15 -4 21
13 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 18 5 6 7 11:17 -6 21
14 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 18 4 8 6 11:14 -3 20
15 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 18 5 4 9 11:13 -2 19
16 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 18 5 3 10 14:22 -8 18
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 18 4 6 8 9:23 -14 18
18 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 18 2 9 7 9:14 -5 15
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.

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