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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Eintracht Frankfurt II | 7 | 5 | 1 | 1 | 13:5 | 8 | 16 |
| 2 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 7 | 4 | 2 | 1 | 11:5 | 6 | 14 |
| 3 |
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SV Wehen Wiesbaden II | 6 | 4 | 1 | 1 | 10:2 | 8 | 13 |
| 4 |
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Waldhof Mannheim | 7 | 4 | 0 | 3 | 15:7 | 8 | 12 |
| 5 |
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TSV 1860 München II | 7 | 3 | 2 | 2 | 11:9 | 2 | 11 |
| 6 |
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Karlsruher SC II | 6 | 3 | 1 | 2 | 11:9 | 2 | 10 |
| 7 |
|
1. FC Nürnberg II | 6 | 3 | 1 | 2 | 8:7 | 1 | 10 |
| 8 |
|
Hessen Kassel | 7 | 2 | 3 | 2 | 11:9 | 2 | 9 |
| 9 |
|
SSV Ulm 1846 | 6 | 2 | 3 | 1 | 9:8 | 1 | 9 |
| 10 |
|
SpVgg Greuther Fürth II | 7 | 2 | 3 | 2 | 8:7 | 1 | 9 |
| 11 |
|
SSV Reutlingen | 7 | 2 | 3 | 2 | 7:12 | -5 | 9 |
| 12 |
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Viktoria Aschaffenburg | 6 | 2 | 2 | 2 | 6:5 | 1 | 8 |
| 13 |
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SC Pfullendorf | 6 | 2 | 2 | 2 | 6:8 | -2 | 8 |
| 14 |
|
SV Darmstadt 98 | 6 | 2 | 1 | 3 | 5:7 | -2 | 7 |
| 15 |
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1. FC Eintracht Bamberg | 6 | 1 | 3 | 2 | 16:18 | -2 | 6 |
| 16 |
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SpVgg Unterhaching II | 6 | 1 | 2 | 3 | 7:13 | -6 | 5 |
| 17 |
|
SC Freiburg II | 7 | 1 | 2 | 4 | 6:15 | -9 | 5 |
| 18 |
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TSV Großbardorf | 7 | 0 | 3 | 4 | 6:16 | -10 | 3 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Das Spiel Unterhaching II - 1860 II (25. Spieltag) wurde wegen des Einsatzes eines nicht spielberechtigten Spielers mit 0:2 gewertet. # Viktoria Aschaffenburg hat aus finanziellen Gründen keine Lizenz für die Saison 2009/2010 beantragt und steht damit als Absteiger fest. |
