| DFB-Nachwuchsliga | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 1 | 1 | 0 | 0 | 9 | : | 0 | |
| Auswärts | 1 | 1 | 0 | 0 | 6 | : | 1 | |
| ∑ | 2 | 2 | 0 | 0 | 15 | : | 1 | |
| DFB-Pokal | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Auswärts | 1 | 1 | 0 | 0 | 4 | : | 2 | |
| ∑ | 1 | 1 | 0 | 0 | 4 | : | 2 | |
| Bundesliga Nord/Nordost | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 4 | 2 | 1 | 1 | 10 | : | 6 | |
| Auswärts | 2 | 2 | 0 | 0 | 5 | : | 3 | |
| ∑ | 6 | 4 | 1 | 1 | 15 | : | 9 | |
| GESAMT | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 5 | 3 | 1 | 1 | 19 | : | 6 | |
| Auswärts | 4 | 4 | 0 | 0 | 15 | : | 6 | |
| Neutraler Ort | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | : | 0 | |
| ∑ | 9 | 7 | 1 | 1 | 34 | : | 12 | |
| DFB-Nachwuchsliga | |||||
| 2024/2025 Vorrunde | Gruppe B | Holstein Kiel | - | 1. FC Magdeburg | 1:6 (0:5) |
| 2024/2025 Vorrunde | Gruppe B | 1. FC Magdeburg | - | Holstein Kiel | 9:0 (4:0) |
| DFB-Pokal | |||||
| 1998/1999 | 1. Runde | Holstein Kiel | - | 1. FC Magdeburg | 2:4 n.V. |
|
Für Spiele, die im Elfmeterschießen entschieden wurden, geht der Spielstand nach 120 Minuten in diese Wertung ein. |
![1. FC Magdeburg [A-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mittel/14884.gif?fallback=png "1. FC Magdeburg [A-Junioren]")
Deutschland 
![1. FC Magdeburg [B-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/14885.gif?fallback=png "1. FC Magdeburg [B-Junioren]"){kind=small}
![1. FC Magdeburg II (U16) [B-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/40261.gif?fallback=png "1. FC Magdeburg II (U16) [B-Junioren]"){kind=small}
![1. FC Magdeburg [C-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/20649.gif?fallback=png "1. FC Magdeburg [C-Junioren]"){kind=small}