| Bundesliga Nord/Nordost | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 2 | 1 | 0 | 1 | 4 | : | 4 | |
| Auswärts | 3 | 1 | 1 | 1 | 6 | : | 7 | |
| ∑ | 5 | 2 | 1 | 2 | 10 | : | 11 | |
| DFB-Pokal | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 1 | 1 | 0 | 0 | 5 | : | 2 | |
| ∑ | 1 | 1 | 0 | 0 | 5 | : | 2 | |
| GESAMT | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 3 | 2 | 0 | 1 | 9 | : | 6 | |
| Auswärts | 3 | 1 | 1 | 1 | 6 | : | 7 | |
| Neutraler Ort | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | : | 0 | |
| ∑ | 6 | 3 | 1 | 2 | 15 | : | 13 | |
| DFB-Pokal | |||||
| 1999/2000 | 1. Runde | 1. FC Magdeburg | - | VfL Osnabrück | 5:2 |
|
Für Spiele, die im Elfmeterschießen entschieden wurden, geht der Spielstand nach 120 Minuten in diese Wertung ein. |
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Deutschland 
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![1. FC Magdeburg [C-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/20649.gif?fallback=png "1. FC Magdeburg [C-Junioren]"){kind=small}