| Regionalliga Nord | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 1 | 1 | 0 | 0 | 4 | : | 1 | |
| Auswärts | 1 | 1 | 0 | 0 | 3 | : | 1 | |
| ∑ | 2 | 2 | 0 | 0 | 7 | : | 2 | |
| Regionalliga Nordost | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 10 | 5 | 2 | 3 | 20 | : | 14 | |
| Auswärts | 9 | 3 | 4 | 2 | 14 | : | 9 | |
| ∑ | 19 | 8 | 6 | 5 | 34 | : | 23 | |
| Regionalliga Nordost (1994-2000) | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 2 | 2 | 0 | 0 | 5 | : | 1 | |
| Auswärts | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | : | 2 | |
| ∑ | 4 | 2 | 1 | 1 | 6 | : | 3 | |
| GESAMT | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 13 | 8 | 2 | 3 | 29 | : | 16 | |
| Auswärts | 12 | 4 | 5 | 3 | 18 | : | 12 | |
| Neutraler Ort | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | : | 0 | |
| ∑ | 25 | 12 | 7 | 6 | 47 | : | 28 | |
| Regionalliga Nord | |||||
| 2005/2006 | 22. Spieltag | FC Carl Zeiss Jena | - | Hertha BSC II | 4:1 (1:1) |
| 2005/2006 | 3. Spieltag | Hertha BSC II | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:3 (0:1) |
|
Für Spiele, die im Elfmeterschießen entschieden wurden, geht der Spielstand nach 120 Minuten in diese Wertung ein. |
Deutschland 
![FC Carl Zeiss Jena [Frauen]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/2382.gif?fallback=png "FC Carl Zeiss Jena [Frauen]"){kind=small}
![FC Carl Zeiss Jena II [Frauen]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/12519.gif?fallback=png "FC Carl Zeiss Jena II [Frauen]"){kind=small}
![FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/10850.gif?fallback=png "FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren]"){kind=small}
![FC Carl Zeiss Jena [B-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/14892.gif?fallback=png "FC Carl Zeiss Jena [B-Junioren]"){kind=small}
![FC Carl Zeiss Jena II [B-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/37759.gif?fallback=png "FC Carl Zeiss Jena II [B-Junioren]"){kind=small}
![FC Carl Zeiss Jena [B-Juniorinnen]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/13944.gif?fallback=png "FC Carl Zeiss Jena [B-Juniorinnen]"){kind=small}
![FC Carl Zeiss Jena [C-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/20651.gif?fallback=png "FC Carl Zeiss Jena [C-Junioren]"){kind=small}
