| 23. Spieltag | 01.03.2025 | Bayern München II | - | Würzburger Kickers | 0:2 | ||||
| 24. Spieltag | 08.03.2025 | Würzburger Kickers | - | Viktoria Aschaffenburg | 0:0 |  |
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| 25. Spieltag | 14.03.2025 | SpVgg Bayreuth | - | Würzburger Kickers | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 22.03.2025 | DJK Vilzing | - | Würzburger Kickers | 1:1 | ||||
| 27. Spieltag | 29.03.2025 | Würzburger Kickers | - | FC Augsburg II | 0:3 | ||||
| 28. Spieltag | 05.04.2025 | TSV Aubstadt | - | Würzburger Kickers | 0:1 | ||||
| 21. Spieltag | 08.04.2025 | SpVgg Ansbach | - | Würzburger Kickers | 1:2 |  |
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| 29. Spieltag | 12.04.2025 | Würzburger Kickers | - | SpVgg Hankofen-Hailing | 5:1 | |
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| 30. Spieltag | 20.04.2025 | TSV Buchbach | - | Würzburger Kickers | 1:0 | ||||
| 31. Spieltag | 25.04.2025 | Würzburger Kickers | - | Eintracht Bamberg | 1:1 | |
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| 32. Spieltag | 02.05.2025 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Würzburger Kickers | 2:1 |
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