1. Spieltag | 05.08.2006 | Wuppertaler SV | - | FC St. Pauli | 3:1 | ||||
2. Spieltag | 09.08.2006 | FC St. Pauli | - | Borussia Dortmund II | 2:1 | ||||
17. Spieltag | 17.11.2006 | FC St. Pauli | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:1 | ||||
22. Spieltag | 17.02.2007 | FC St. Pauli | - | VfB Lübeck | 2:0 | ||||
21. Spieltag | 21.02.2007 | Borussia Dortmund II | - | FC St. Pauli | 0:1 | ||||
25. Spieltag | 10.03.2007 | 1. FC Union Berlin | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
26. Spieltag | 16.03.2007 | FC St. Pauli | - | SV Wilhelmshaven | 2:0 | ||||
27. Spieltag | 24.03.2007 | Bayer Leverkusen II | - | FC St. Pauli | 2:1 | ||||
28. Spieltag | 27.03.2007 | FC St. Pauli | - | Kickers Emden | 2:0 | ||||
30. Spieltag | 04.04.2007 | Hamburger SV II | - | FC St. Pauli | 0:0 | ||||
31. Spieltag | 14.04.2007 | FC St. Pauli | - | Holstein Kiel | 2:0 | ||||
33. Spieltag | 27.04.2007 | FC St. Pauli | - | Rot Weiss Ahlen | 3:0 | ||||
34. Spieltag | 05.05.2007 | VfL Osnabrück | - | FC St. Pauli | 0:0 | ||||
35. Spieltag | 12.05.2007 | FC St. Pauli | - | Fortuna Düsseldorf | 2:0 | ||||
38. Spieltag | 02.06.2007 | 1. FC Magdeburg | - | FC St. Pauli | 1:1 |