| 5. Spieltag | 12.08.2012 | Hansa Rostock | - | Chemnitzer FC | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 20.10.2012 | Hansa Rostock | - | Alemannia Aachen | 1:0 | ||||
| 20. Spieltag | 01.12.2012 | Stuttgarter Kickers | - | Hansa Rostock | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 26.01.2013 | Hansa Rostock | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 30. Spieltag | 16.03.2013 | Hansa Rostock | - | VfB Stuttgart II | 0:0 | ||||
| 33. Spieltag | 12.04.2013 | Alemannia Aachen | - | Hansa Rostock | 3:4 | ||||
| 22. Spieltag | 16.04.2013 | SV Babelsberg 03 | - | Hansa Rostock | 2:1 | ||||
| 34. Spieltag | 20.04.2013 | Hansa Rostock | - | Borussia Dortmund II | 2:0 |  |
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| 35. Spieltag | 27.04.2013 | 1. FC Saarbrücken | - | Hansa Rostock | 1:1 | |
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| 36. Spieltag | 04.05.2013 | Hansa Rostock | - | Kickers Offenbach | 2:2 | |
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| 37. Spieltag | 11.05.2013 | Karlsruher SC | - | Hansa Rostock | 1:1 | ||||
| 38. Spieltag | 18.05.2013 | Hansa Rostock | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:0 |
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