| 20. Spieltag | 03.03.2013 | FK Senica | - | MFK Ružomberok | 0:3 | ||||
| 21. Spieltag | 08.03.2013 | Zlaté Moravce | - | FK Senica | 0:2 | ||||
| 22. Spieltag | 15.03.2013 | FK Senica | - | FC Nitra | 2:1 | ||||
| 23. Spieltag | 30.03.2013 | FK Senica | - | FK Dukla Banská Bystrica | 1:1 | ||||
| 24. Spieltag | 02.04.2013 | 1. FC Tatran Prešov | - | FK Senica | 0:1 |  |
|||
| 25. Spieltag | 06.04.2013 | FK Senica | - | MFK Košice | 0:0 | ||||
| 26. Spieltag | 13.04.2013 | MŠK Žilina | - | FK Senica | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 21.04.2013 | FK Senica | - | Spartak Trnava | 3:2 | ||||
| 28. Spieltag | 27.04.2013 | Slovan Bratislava | - | FK Senica | 3:2 | ||||
| 29. Spieltag | 04.05.2013 | FK Senica | - | Spartak Myjava | 0:3 | ||||
| 30. Spieltag | 10.05.2013 | FK Senica | - | AS Trenčín | 1:0 | ||||
| 31. Spieltag | 18.05.2013 | MFK Ružomberok | - | FK Senica | 3:1 | |
|||
| 32. Spieltag | 22.05.2013 | FK Senica | - | Zlaté Moravce | 1:0 |
Tschechien