| 24. Spieltag | 24.02.2007 | 1. FC Bad Kötzting | - | SpVgg Bayreuth | 2:1 | ||||
| 25. Spieltag | 03.03.2007 | VfL Frohnlach | - | 1. FC Bad Kötzting | 3:2 | ||||
| 26. Spieltag | 10.03.2007 | 1. FC Bad Kötzting | - | SC Fürstenfeldbruck | 6:1 | ||||
| 27. Spieltag | 17.03.2007 | Jahn Regensburg | - | 1. FC Bad Kötzting | 4:1 | ||||
| 28. Spieltag | 24.03.2007 | 1. FC Bad Kötzting | - | Wacker Burghausen II | 3:2 | ||||
| 23. Spieltag | 28.03.2007 | FC Ismaning | - | 1. FC Bad Kötzting | 3:0 | ||||
| 29. Spieltag | 31.03.2007 | SpVgg Bayern Hof | - | 1. FC Bad Kötzting | 0:0 | ||||
| 30. Spieltag | 07.04.2007 | 1. FC Bad Kötzting | - | SpVgg Unterhaching II | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 14.04.2007 | SpVgg Greuther Fürth II | - | 1. FC Bad Kötzting | 3:1 | ||||
| 32. Spieltag | 21.04.2007 | 1. FC Bad Kötzting | - | SpVgg Weiden | 0:0 | ||||
| 34. Spieltag | 05.05.2007 | TSV Großbardorf | - | 1. FC Bad Kötzting | 1:1 | ||||
| 35. Spieltag | 12.05.2007 | 1. FC Bad Kötzting | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 4:2 |  |
|||
| 37. Spieltag | 25.05.2007 | 1. FC Bad Kötzting | - | 1. SC Feucht | 4:0 |  |
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| 38. Spieltag | 02.06.2007 | SV Heimstetten | - | 1. FC Bad Kötzting | 4:2 |
Tschechien