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| Tabelle | Heim | » Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Bayern München II | 13 | 9 | 2 | 2 | 29:10 | 19 | 29 |
| 2 |
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VfB Eichstätt | 13 | 8 | 3 | 2 | 24:14 | 10 | 27 |
| 3 |
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SV Schalding-Heining | 12 | 7 | 3 | 2 | 18:13 | 5 | 24 |
| 4 |
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FC Memmingen | 13 | 7 | 2 | 4 | 23:21 | 2 | 23 |
| 5 |
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TSV Buchbach | 13 | 6 | 4 | 3 | 21:12 | 9 | 22 |
| 6 |
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Wacker Burghausen | 14 | 6 | 3 | 5 | 18:15 | 3 | 21 |
| 7 |
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1. FC Nürnberg II | 13 | 5 | 4 | 4 | 12:12 | 0 | 19 |
| 8 |
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1. FC Schweinfurt 05 | 14 | 3 | 9 | 2 | 18:22 | -4 | 18 |
| 9 |
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SpVgg Bayreuth | 12 | 5 | 2 | 5 | 23:20 | 3 | 17 |
| 10 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 14 | 4 | 5 | 5 | 20:21 | -1 | 17 |
| 11 |
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FV Illertissen | 13 | 5 | 2 | 6 | 17:22 | -5 | 17 |
| 12 |
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SV Heimstetten | 13 | 4 | 2 | 7 | 20:25 | -5 | 14 |
| 13 |
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FC Augsburg II | 13 | 4 | 2 | 7 | 16:21 | -5 | 14 |
| 14 |
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Viktoria Aschaffenburg | 13 | 2 | 7 | 4 | 18:25 | -7 | 13 |
| 15 |
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TSV 1860 Rosenheim | 13 | 4 | 1 | 8 | 8:22 | -14 | 13 |
| 16 |
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VfR Garching | 12 | 3 | 3 | 6 | 15:21 | -6 | 12 |
| 17 |
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FC Ingolstadt 04 II | 13 | 2 | 5 | 6 | 15:23 | -8 | 11 |
| 18 |
|
FC Pipinsried | 13 | 3 | 2 | 8 | 15:31 | -16 | 11 |
| Playoffs | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz. |
