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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Eintracht Frankfurt II | 8 | 6 | 1 | 1 | 15:6 | 9 | 19 |
| 2 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 8 | 5 | 2 | 1 | 13:5 | 8 | 17 |
| 3 |
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Waldhof Mannheim | 8 | 5 | 0 | 3 | 16:7 | 9 | 15 |
| 4 |
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SV Wehen Wiesbaden II | 7 | 4 | 1 | 2 | 11:4 | 7 | 13 |
| 5 |
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TSV 1860 München II | 7 | 3 | 2 | 2 | 11:9 | 2 | 11 |
| 6 |
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SV Darmstadt 98 | 8 | 3 | 2 | 3 | 10:8 | 2 | 11 |
| 7 |
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1. FC Nürnberg II | 7 | 3 | 2 | 2 | 9:8 | 1 | 11 |
| 8 |
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SSV Ulm 1846 | 7 | 2 | 4 | 1 | 10:9 | 1 | 10 |
| 9 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 8 | 2 | 4 | 2 | 9:8 | 1 | 10 |
| 10 |
|
Karlsruher SC II | 7 | 3 | 1 | 3 | 11:11 | 0 | 10 |
| 11 |
|
Hessen Kassel | 8 | 2 | 3 | 3 | 12:11 | 1 | 9 |
| 12 |
|
SSV Reutlingen | 8 | 2 | 3 | 3 | 8:14 | -6 | 9 |
| 13 |
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Viktoria Aschaffenburg | 7 | 2 | 2 | 3 | 6:8 | -2 | 8 |
| 14 |
|
SC Pfullendorf | 7 | 2 | 2 | 3 | 7:13 | -6 | 8 |
| 15 |
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1. FC Eintracht Bamberg | 7 | 1 | 3 | 3 | 17:21 | -4 | 6 |
| 16 |
|
SpVgg Unterhaching II | 7 | 1 | 2 | 4 | 8:15 | -7 | 5 |
| 17 |
|
SC Freiburg II | 8 | 1 | 2 | 5 | 6:17 | -11 | 5 |
| 18 |
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TSV Großbardorf | 8 | 0 | 3 | 5 | 6:17 | -11 | 3 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Das Spiel Unterhaching II - 1860 II (25. Spieltag) wurde wegen des Einsatzes eines nicht spielberechtigten Spielers mit 0:2 gewertet. # Viktoria Aschaffenburg hat aus finanziellen Gründen keine Lizenz für die Saison 2009/2010 beantragt und steht damit als Absteiger fest. |
