| Bundesliga | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 4 | 0 | 1 | 3 | 4 | : | 7 | |
| Auswärts | 4 | 1 | 2 | 1 | 7 | : | 6 | |
| ∑ | 8 | 1 | 3 | 4 | 11 | : | 13 | |
| 2. Bundesliga | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 1 | 1 | 0 | 0 | 3 | : | 1 | |
| Auswärts | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | : | 5 | |
| ∑ | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | : | 6 | |
| Bundesliga Cup | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Auswärts | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | : | 2 | |
| ∑ | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | : | 2 | |
| GESAMT | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 5 | 1 | 1 | 3 | 7 | : | 8 | |
| Auswärts | 6 | 1 | 2 | 3 | 8 | : | 13 | |
| Neutraler Ort | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | : | 0 | |
| ∑ | 11 | 2 | 3 | 6 | 15 | : | 21 | |
| 2. Bundesliga | |||||
| 2023/2024 | 20. Spieltag | FC Carl Zeiss Jena | - | Hamburger SV | 3:1 (2:0) |
| 2023/2024 | 7. Spieltag | Hamburger SV | - | FC Carl Zeiss Jena | 5:0 (1:0) |
| Bundesliga Cup | |||||
| 2011 | Gruppe B | Hamburger SV | - | FF USV Jena | 2:1 (0:0) |
|
Für Spiele, die im Elfmeterschießen entschieden wurden, geht der Spielstand nach 120 Minuten in diese Wertung ein. |
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Deutschland 
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![FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/10850.gif?fallback=png "FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren]"){kind=small}
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![FC Carl Zeiss Jena [C-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/20651.gif?fallback=png "FC Carl Zeiss Jena [C-Junioren]"){kind=small}
