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| 17.10.1998 | 14:00 | FK Nevėžis | - | FK Ekranas | 1:0 | |
| 14:00 | Mastis Telšiai | - | FK Zalgiris | 0:6 | ||
| 14:00 | FBK Kaunas | - | Lokomotyvas Kaunas | 2:0 | ||
| 14:00 | FK Atlantas | - | Kauno Jegeriai | 7:1 | ||
| 14:00 | FK Žalgiris B | - | FK Kareda Siauliai | 0:4 | ||
| 20.10.1998 | 14:00 | FK Banga Gargždai | - | FK Dainava Alytus | 2:0 |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FBK Kaunas | 11 | 9 | 2 | 0 | 31:3 | 28 | 29 |
| 2 |
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FK Zalgiris | 10 | 8 | 2 | 0 | 31:4 | 27 | 28 |
| 3 |
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FK Kareda Siauliai | 10 | 7 | 3 | 0 | 32:4 | 28 | 24 |
| 4 |
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FK Ekranas | 10 | 5 | 2 | 3 | 16:8 | 8 | 16 |
| 5 |
|
FK Nevėžis | 10 | 5 | 0 | 5 | 10:17 | -7 | 15 |
| 6 |
|
FK Atlantas | 11 | 4 | 2 | 5 | 15:15 | 0 | 14 |
| 7 |
|
FK Banga Gargždai | 10 | 3 | 3 | 4 | 6:8 | -2 | 12 |
| 8 |
|
FK Dainava Alytus | 10 | 4 | 0 | 6 | 12:29 | -17 | 12 |
| 9 |
|
Inkaras Kaunas | 10 | 3 | 2 | 5 | 8:12 | -4 | 11 |
| 10 |
|
Lokomotyvas Kaunas | 10 | 3 | 0 | 7 | 6:14 | -8 | 9 |
| 11 |
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FK Žalgiris B | 10 | 3 | 0 | 7 | 7:19 | -12 | 9 |
| 12 |
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Kauno Jegeriai | 10 | 2 | 2 | 6 | 6:23 | -17 | 8 |
| 13 |
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Mastis Telšiai | 10 | 1 | 0 | 9 | 3:27 | -24 | 3 |
| 14 |
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FK Panerys | 0 | 0 | 0 | 0 | 0:0 | 0 | 0 |
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# Ekranas - Zalgiris (26.05.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Zalgiris gewertet, wobei Zalgiris die drei Punkte zugesporechen wurden (ursprünglich 1:0 für Ekranas) # Nach dem 6. Spieltag zog Panerys Vilnius sein Team zurück. Alle Partien wurden annulliert. # Nach dem 13. Spieltag zog Mastis Telsiai seine Mannschaft zurück. Alle bis dahin gespielten Partien behielten ihre Gültigkeit. |
