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| 03.10.1998 | 14:30 | Lokomotyvas Kaunas | - | Inkaras Kaunas | 0:1 | |
| 14:30 | FBK Kaunas | - | FK Atlantas | 1:0 | ||
| 14:30 | FK Dainava Alytus | - | FK Žalgiris B | 2:1 | ||
| 04.10.1998 | 14:30 | FK Kareda Siauliai | - | Mastis Telšiai | 9:0 | |
| 14:30 | FK Zalgiris | - | FK Nevėžis | 6:0 | ||
| 14:30 | Kauno Jegeriai | - | FK Banga Gargždai | 0:0 |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FBK Kaunas | 10 | 8 | 2 | 0 | 29:3 | 26 | 26 |
| 2 |
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FK Zalgiris | 9 | 7 | 2 | 0 | 25:4 | 21 | 25 |
| 3 |
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FK Kareda Siauliai | 9 | 6 | 3 | 0 | 28:4 | 24 | 21 |
| 4 |
|
FK Ekranas | 9 | 5 | 2 | 2 | 16:7 | 9 | 16 |
| 5 |
|
FK Nevėžis | 9 | 4 | 0 | 5 | 9:17 | -8 | 12 |
| 6 |
|
FK Dainava Alytus | 9 | 4 | 0 | 5 | 12:27 | -15 | 12 |
| 7 |
|
Inkaras Kaunas | 10 | 3 | 2 | 5 | 8:12 | -4 | 11 |
| 8 |
|
FK Atlantas | 10 | 3 | 2 | 5 | 8:14 | -6 | 11 |
| 9 |
|
FK Banga Gargždai | 9 | 2 | 3 | 4 | 4:8 | -4 | 9 |
| 10 |
|
Lokomotyvas Kaunas | 9 | 3 | 0 | 6 | 6:12 | -6 | 9 |
| 11 |
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FK Žalgiris B | 9 | 3 | 0 | 6 | 7:15 | -8 | 9 |
| 12 |
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Kauno Jegeriai | 9 | 2 | 2 | 5 | 5:16 | -11 | 8 |
| 13 |
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Mastis Telšiai | 9 | 1 | 0 | 8 | 3:21 | -18 | 3 |
| 14 |
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FK Panerys | 0 | 0 | 0 | 0 | 0:0 | 0 | 0 |
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# Ekranas - Zalgiris (26.05.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Zalgiris gewertet, wobei Zalgiris die drei Punkte zugesporechen wurden (ursprünglich 1:0 für Ekranas) # Nach dem 6. Spieltag zog Panerys Vilnius sein Team zurück. Alle Partien wurden annulliert. # Nach dem 13. Spieltag zog Mastis Telsiai seine Mannschaft zurück. Alle bis dahin gespielten Partien behielten ihre Gültigkeit. |
