# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FBK Kaunas, Litauen FBK Kaunas 9 7 2 0 28:3 25 23
2 FK Zalgiris, Litauen FK Zalgiris 8 6 2 0 19:4 15 22
3 FK Kareda Siauliai, Litauen FK Kareda Siauliai 8 5 3 0 19:4 15 18
4 FK Ekranas, Litauen FK Ekranas 9 5 2 2 16:7 9 16
5 FK Nevėžis, Litauen FK Nevėžis 8 4 0 4 9:11 -2 12
6 FK Atlantas, Litauen FK Atlantas 9 3 2 4 8:13 -5 11
7 Lokomotyvas Kaunas, Litauen Lokomotyvas Kaunas 8 3 0 5 6:11 -5 9
8 FK Žalgiris B, Litauen FK Žalgiris B 8 3 0 5 6:13 -7 9
9 FK Dainava Alytus, Litauen FK Dainava Alytus 8 3 0 5 10:26 -16 9
10 FK Banga Gargždai, Litauen FK Banga Gargždai 8 2 2 4 4:8 -4 8
11 Inkaras Kaunas, Litauen Inkaras Kaunas 9 2 2 5 7:12 -5 8
12 Kauno Jegeriai, Litauen Kauno Jegeriai 8 2 1 5 5:16 -11 7
13 Mastis Telšiai, Litauen Mastis Telšiai 8 1 0 7 3:12 -9 3
14 FK Panerys, Litauen FK Panerys 0 0 0 0 0:0 0 0

# Ekranas - Zalgiris (26.05.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Zalgiris gewertet, wobei Zalgiris die drei Punkte zugesporechen wurden (ursprünglich 1:0 für Ekranas)

# Nach dem 6. Spieltag zog Panerys Vilnius sein Team zurück. Alle Partien wurden annulliert.

# Nach dem 13. Spieltag zog Mastis Telsiai seine Mannschaft zurück. Alle bis dahin gespielten Partien behielten ihre Gültigkeit.

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