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| 08.11.2008 | 14:00 | Energie Cottbus II | - | SV Wilhelmshaven | 1:0 (0:0) | |
| 14:00 | Holstein Kiel | - | Hamburger SV II | 2:1 (0:1) | ||
| 14:00 | Hannover 96 II | - | Hertha BSC II | 4:2 (2:2) | ||
| 14:00 | Chemnitzer FC | - | VfL Wolfsburg II | 1:1 (1:0) | ||
| 14:00 | Türkiyemspor Berlin | - | Sachsen Leipzig | 2:0 (1:0) | ||
| 09.11.2008 | 14:00 | Altona 93 | - | VfB Lübeck | 0:0 (0:0) | |
| 14:00 | 1. FC Magdeburg | - | Hansa Rostock II | 2:1 (1:1) | ||
| 14:00 | FC Oberneuland | - | VFC Plauen | 1:2 (1:0) | ||
| 03.12.2008 | 19:00 | SV Babelsberg 03 | - | Hallescher FC | 0:2 (0:1) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Holstein Kiel | 12 | 8 | 2 | 2 | 20:11 | 9 | 26 |
| 2 |
|
SV Babelsberg 03 | 12 | 7 | 4 | 1 | 14:6 | 8 | 25 |
| 3 |
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Hallescher FC | 12 | 6 | 6 | 0 | 14:7 | 7 | 24 |
| 4 |
|
1. FC Magdeburg | 12 | 7 | 2 | 3 | 16:9 | 7 | 23 |
| 5 |
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VFC Plauen | 12 | 5 | 5 | 2 | 20:13 | 7 | 20 |
| 6 |
|
SV Wilhelmshaven | 12 | 5 | 5 | 2 | 18:14 | 4 | 20 |
| 7 |
|
VfL Wolfsburg II | 12 | 5 | 3 | 4 | 19:12 | 7 | 18 |
| 8 |
|
Hannover 96 II | 12 | 5 | 2 | 5 | 19:16 | 3 | 17 |
| 9 |
|
Altona 93 | 12 | 5 | 2 | 5 | 20:20 | 0 | 17 |
| 10 |
|
FC Oberneuland | 12 | 5 | 2 | 5 | 12:14 | -2 | 17 |
| 11 |
|
Hamburger SV II | 12 | 4 | 3 | 5 | 15:14 | 1 | 15 |
| 12 |
|
Hansa Rostock II | 12 | 4 | 2 | 6 | 17:23 | -6 | 14 |
| 13 |
|
Chemnitzer FC | 12 | 3 | 4 | 5 | 17:16 | 1 | 13 |
| 14 |
|
VfB Lübeck | 12 | 2 | 5 | 5 | 12:15 | -3 | 11 |
| 15 |
|
Türkiyemspor Berlin | 12 | 3 | 2 | 7 | 11:18 | -7 | 11 |
| 16 |
|
Sachsen Leipzig | 12 | 2 | 4 | 6 | 6:15 | -9 | 10 |
| 17 |
|
Hertha BSC II | 12 | 3 | 1 | 8 | 11:26 | -15 | 10 |
| 18 |
|
Energie Cottbus II | 12 | 1 | 2 | 9 | 7:19 | -12 | 5 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest. # Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest. # Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet. |
