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| 14.11.2008 | 19:00 | 1. FC Magdeburg | - | Energie Cottbus II | 3:1 (1:1) | |
| 15.11.2008 | 14:00 | Hansa Rostock II | - | Hallescher FC | 0:1 (0:1) | |
| 14:00 | SV Wilhelmshaven | - | Altona 93 | 4:1 (2:0) | ||
| 14:00 | VfB Lübeck | - | Türkiyemspor Berlin | 3:0 (1:0) | ||
| 16.11.2008 | 14:00 | Hamburger SV II | - | SV Babelsberg 03 | 0:0 (0:0) | |
| 14:00 | Sachsen Leipzig | - | FC Oberneuland | 0:3 (0:1) | ||
| 14:00 | VFC Plauen | - | Chemnitzer FC | 0:4 (0:3) | ||
| 14:00 | VfL Wolfsburg II | - | Hannover 96 II | 1:0 (0:0) | ||
| 14:00 | Hertha BSC II | - | Holstein Kiel | 1:1 (1:0) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Holstein Kiel | 13 | 8 | 3 | 2 | 21:12 | 9 | 27 |
| 2 |
|
Hallescher FC | 13 | 7 | 6 | 0 | 15:7 | 8 | 27 |
| 3 |
|
1. FC Magdeburg | 13 | 8 | 2 | 3 | 19:10 | 9 | 26 |
| 4 |
|
SV Babelsberg 03 | 13 | 7 | 5 | 1 | 14:6 | 8 | 26 |
| 5 |
|
SV Wilhelmshaven | 13 | 6 | 5 | 2 | 22:15 | 7 | 23 |
| 6 |
|
VfL Wolfsburg II | 13 | 6 | 3 | 4 | 20:12 | 8 | 21 |
| 7 |
|
VFC Plauen | 13 | 5 | 5 | 3 | 20:17 | 3 | 20 |
| 8 |
|
FC Oberneuland | 13 | 6 | 2 | 5 | 15:14 | 1 | 20 |
| 9 |
|
Hannover 96 II | 13 | 5 | 2 | 6 | 19:17 | 2 | 17 |
| 10 |
|
Altona 93 | 13 | 5 | 2 | 6 | 21:24 | -3 | 17 |
| 11 |
|
Chemnitzer FC | 13 | 4 | 4 | 5 | 21:16 | 5 | 16 |
| 12 |
|
Hamburger SV II | 13 | 4 | 4 | 5 | 15:14 | 1 | 16 |
| 13 |
|
VfB Lübeck | 13 | 3 | 5 | 5 | 15:15 | 0 | 14 |
| 14 |
|
Hansa Rostock II | 13 | 4 | 2 | 7 | 17:24 | -7 | 14 |
| 15 |
|
Türkiyemspor Berlin | 13 | 3 | 2 | 8 | 11:21 | -10 | 11 |
| 16 |
|
Hertha BSC II | 13 | 3 | 2 | 8 | 12:27 | -15 | 11 |
| 17 |
|
Sachsen Leipzig | 13 | 2 | 4 | 7 | 6:18 | -12 | 10 |
| 18 |
|
Energie Cottbus II | 13 | 1 | 2 | 10 | 8:22 | -14 | 5 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest. # Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest. # Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet. |
