# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FBK Kaunas, Litauen FBK Kaunas 9 8 1 0 20:4 16 25
2 FK Zalgiris, Litauen FK Zalgiris 7 6 1 0 26:3 23 19
3 FK Kareda Siauliai, Litauen FK Kareda Siauliai 7 5 2 0 15:4 11 17
4 FK Ekranas, Litauen FK Ekranas 6 3 0 3 14:7 7 9
5 FK Dainava Alytus, Litauen FK Dainava Alytus 7 3 0 4 8:22 -14 9
6 FK Atlantas, Litauen FK Atlantas 6 2 2 2 4:8 -4 8
7 FK Nevėžis, Litauen FK Nevėžis 7 2 1 4 8:17 -9 7
8 Lokomotyvas Kaunas, Litauen Lokomotyvas Kaunas 7 2 0 5 6:15 -9 6
9 Inkaras Kaunas, Litauen Inkaras Kaunas 6 1 2 3 3:7 -4 5
10 FK Banga Gargždai, Litauen FK Banga Gargždai 8 1 1 6 2:15 -13 4
11 Kauno Jegeriai, Litauen Kauno Jegeriai 7 1 1 5 2:16 -14 4
12 FK Žalgiris B, Litauen FK Žalgiris B 7 1 0 6 4:21 -17 3
13 FK Panerys, Litauen FK Panerys 0 0 0 0 0:0 0 0
14 Mastis Telšiai, Litauen Mastis Telšiai 6 0 0 6 2:22 -20 0

# Ekranas - Zalgiris (26.05.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Zalgiris gewertet, wobei Zalgiris die drei Punkte zugesporechen wurden (ursprünglich 1:0 für Ekranas)

# Nach dem 6. Spieltag zog Panerys Vilnius sein Team zurück. Alle Partien wurden annulliert.

# Nach dem 13. Spieltag zog Mastis Telsiai seine Mannschaft zurück. Alle bis dahin gespielten Partien behielten ihre Gültigkeit.

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