# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 22 15 5 2 48:16 32 50
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 22 13 5 4 42:26 16 44
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 22 8 11 3 39:29 10 35
4 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 22 10 5 7 29:24 5 35
5 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 22 10 5 7 37:34 3 35
6 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 22 9 7 6 28:20 8 34
7 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 22 9 6 7 37:29 8 33
8 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 22 9 6 7 26:27 -1 33
9 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 22 6 9 7 32:34 -2 27
10 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 22 7 5 10 28:31 -3 26
11 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 22 7 5 10 30:40 -10 26
12 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 22 6 7 9 27:33 -6 25
13 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 22 7 4 11 27:34 -7 25
14 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 22 6 5 11 28:29 -1 23
15 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 22 6 4 12 18:38 -20 22
16 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 22 4 8 10 32:44 -12 20
17 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 22 5 4 13 32:49 -17 19
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 22 8 5 9 29:32 -3 -16
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.

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