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| H | Dundee FC | - | FK Smederevo | 0:0 (0:0) | ||
| R | FK Smederevo | - | Dundee FC | 5:2 (3:1) | ||
| H: 16.06.2001 15:00 | R: 23.06.2001 17:30 | Sieger: FK Smederevo | ||||
| H | Aarhus GF | - | NK Publikum Celje | 1:0 (0:0) | ||
| R | NK Publikum Celje | - | Aarhus GF | 7:1 (4:1) | ||
| H: 16.06.2001 16:00 | R: 23.06.2001 17:30 | Sieger: NK Publikum Celje | ||||
| H | Carmarthen Town | - | AIK Solna | 0:0 (0:0) | ||
| R | AIK Solna | - | Carmarthen Town | 3:0 (2:0) | ||
| H: 16.06.2001 16:00 | R: 23.06.2001 15:00 | Sieger: AIK Solna | ||||
| H | Lombard FC Tatabanya | - | Shirak FC | 2:3 (1:1) | ||
| R | Shirak FC | - | Lombard FC Tatabanya | 1:3 (0:2) | ||
| H: 16.06.2001 17:00 | R: 24.06.2001 17:00 | Sieger: Lombard FC Tatabanya | ||||
| H | Anorthosis Famagusta | - | Slaven Belupo | 0:2 (0:1) | ||
| R | Slaven Belupo | - | Anorthosis Famagusta | 7:0 (4:0) | ||
| H: 16.06.2001 17:00 | R: 23.06.2001 17:00 | Sieger: Slaven Belupo | ||||
| H | B68 Toftir | - | Sporting Lokeren | 2:4 (2:2) | ||
| R | Sporting Lokeren | - | B68 Toftir | 0:0 (0:0) | ||
| H: 16.06.2001 17:00 | R: 23.06.2001 20:00 | Sieger: Sporting Lokeren | ||||
| H | FC Universitatea Craiova | - | KF Bylis Ballsh | 3:3 (2:1) | ||
| R | KF Bylis Ballsh | - | FC Universitatea Craiova | 0:1 (0:0) | ||
| H: 16.06.2001 18:00 | R: 23.06.2001 17:30 | Sieger: FC Universitatea Craiova | ||||
| H | UE Sant Julià | - | Lausanne Sports | 1:3 (1:2) | ||
| R | Lausanne Sports | - | UE Sant Julià | 6:0 (2:0) | ||
| H: 16.06.2001 18:00 | R: 23.06.2001 19:30 | Sieger: Lausanne Sports | ||||
| H | WIT Georgia | - | SV Ried | 1:0 (0:0) | ||
| R | SV Ried | - | WIT Georgia | 2:1 (1:1) | ||
| H: 16.06.2001 18:00 | R: 24.06.2001 17:00 | Sieger: WIT Georgia | ||||
| H | Cork City | - | FK Liepājas Metalurgs | 0:1 (0:0) | ||
| R | FK Liepājas Metalurgs | - | Cork City | 2:1 (2:0) | ||
| H: 16.06.2001 18:30 | R: 23.06.2001 17:00 | Sieger: FK Liepājas Metalurgs | ||||
| H | Dinamo Minsk | - | CS Hobscheid | 6:0 (2:0) | ||
| R | CS Hobscheid | - | Dinamo Minsk | 1:1 (0:0) | ||
| H: 16.06.2001 19:00 | R: 24.06.2001 17:00 | Sieger: Dinamo Minsk | ||||
| H | UMF Grindavík | - | FK Vilash | 1:0 (0:0) | ||
| R | FK Vilash | - | UMF Grindavík | 1:2 (0:2) | ||
| H: 17.06.2001 16:00 | R: 24.06.2001 18:00 | Sieger: UMF Grindavík | ||||
| H | FK Ekranas | - | FK Artmedia Petržalka | 1:1 (1:0) | ||
| R | FK Artmedia Petržalka | - | FK Ekranas | 4:3 (0:0, 1:1, 1:1) i.E. | ||
| H: 17.06.2001 17:00 | R: 24.06.2001 17:00 | Sieger: FK Artmedia Petržalka | ||||
| H | Zagłębie Lubin | - | Hibernians FC | 4:0 (2:0) | ||
| R | Hibernians FC | - | Zagłębie Lubin | 1:0 (0:0) | ||
| H: 17.06.2001 17:00 | R: 23.06.2001 17:00 | Sieger: Zagłębie Lubin | ||||
| H | NK Zagreb | - | FK Pobeda | 1:2 (1:0) | ||
| R | FK Pobeda | - | NK Zagreb | 1:1 (1:1) | ||
| H: 17.06.2001 17:30 | R: 24.06.2001 17:00 | Sieger: FK Pobeda | ||||
| H | Čelik Zenica | - | Denizlispor | 1:0 (1:0) | ||
| R | Denizlispor | - | Čelik Zenica | 3:5 (1:4) | ||
| H: 17.06.2001 17:30 | R: 24.06.2001 19:00 | Sieger: Čelik Zenica | ||||
| H | Groclin Dyskobolia | - | Spartak Varna | 1:0 (0:0) | ||
| R | Spartak Varna | - | Groclin Dyskobolia | 4:0 (1:0) | ||
| H: 17.06.2001 18:00 | R: 24.06.2001 17:30 | Sieger: Spartak Varna | ||||
| H | Hapoel Haifa | - | FC TVMK | 2:0 (0:0) | ||
| R | FC TVMK | - | Hapoel Haifa | 0:3 (0:1) | ||
| H: 17.06.2001 18:00 | R: 23.06.2001 16:00 | Sieger: Hapoel Haifa | ||||
| H | FC Jazz Pori | - | Gloria Bistrița (old) | 1:0 (1:0) | ||
| R | Gloria Bistrița (old) | - | FC Jazz Pori | 2:1 (1:0) | ||
| H: 17.06.2001 19:00 | R: 23.06.2001 17:00 | Sieger: FC Jazz Pori | ||||
| H | Tiligul Tiraspol | - | Cliftonville FC | 1:0 (1:0) | ||
| R | Cliftonville FC | - | Tiligul Tiraspol | 1:3 (1:0, 1:0) n.V. | ||
| H: 17.06.2001 19:00 | R: 23.06.2001 15:00 | Sieger: Tiligul Tiraspol | ||||
