H OFK Beograd - AJ Auxerre 1:0 (1:0)
R AJ Auxerre - OFK Beograd 5:1 (2:1)
H: 08.08.2006 17:00 R: 24.08.2006 20:00 Sieger: AJ Auxerre
H Omonia Nikosia - PFC Litex Lovech 0:0 (0:0)
R PFC Litex Lovech - Omonia Nikosia 2:1 (2:1)
H: 08.08.2006 18:00 R: 24.08.2006 20:45 Sieger: PFC Litex Lovech
H Artmedia Petržalka - Dinamo Minsk 2:1 (0:1)
R Dinamo Minsk - Artmedia Petržalka 2:3 (0:2)
H: 10.08.2006 17:00 R: 24.08.2006 18:00 Sieger: Artmedia Petržalka
H FK Karvan - Slavia Praha 0:2 (0:1)
R Slavia Praha - FK Karvan 0:0 (0:0)
H: 10.08.2006 17:00 R: 24.08.2006 20:45 Sieger: Slavia Praha
H Chernomorets Odessa - Wisła Płock 0:0 (0:0)
R Wisła Płock - Chernomorets Odessa 1:1 (0:1)
H: 10.08.2006 17:00 R: 24.08.2006 17:30 Sieger: Chernomorets Odessa
H Rubin Kazan - BATE Borisov 3:0 (1:0)
R BATE Borisov - Rubin Kazan 0:2 (0:2)
H: 10.08.2006 17:00 R: 24.08.2006 18:30 Sieger: Rubin Kazan
H KF Tiranë - Kayserispor 0:2 (0:2)
R Kayserispor - KF Tiranë 3:1 (1:0)
H: 10.08.2006 17:30 R: 24.08.2006 18:00 Sieger: Kayserispor
H KSV Roeselare - Ethnikos Achna 2:1 (1:0)
R Ethnikos Achna - KSV Roeselare 5:0 (2:0)
H: 10.08.2006 18:00 R: 24.08.2006 17:00 Sieger: Ethnikos Achna
H Bnei Yehuda Tel Aviv - Lokomotiv Sofia 0:2 (0:1)
R Lokomotiv Sofia - Bnei Yehuda Tel Aviv 4:0 (2:0)
H: 10.08.2006 18:00 R: 24.08.2006 19:30 Sieger: Lokomotiv Sofia
H CSKA Sofia - Hajduk Rodić 0:0 (0:0)
R Hajduk Rodić - CSKA Sofia 1:1 (0:0, 0:0) n.V.
H: 10.08.2006 18:30 R: 24.08.2006 20:30 Sieger: CSKA Sofia
H SV Ried - FC Sion 0:0 (0:0)
R FC Sion - SV Ried 1:0 (1:0)
H: 10.08.2006 18:30 R: 24.08.2006 20:00 Sieger: FC Sion
H Hapoel Tel Aviv - NK Domžale 1:2 (1:0)
R NK Domžale - Hapoel Tel Aviv 0:3 (0:0)
H: 10.08.2006 19:00 R: 24.08.2006 18:30 Sieger: Hapoel Tel Aviv
H FC Zimbru - Metalurg Zaporizhya 0:0 (0:0)
R Metalurg Zaporizhya - FC Zimbru 3:0 (1:0)
H: 10.08.2006 19:00 R: 24.08.2006 19:00 Sieger: Metalurg Zaporizhya
H Hertha BSC - FC Ameri 1:0 (0:0)
R FC Ameri - Hertha BSC 2:2 (1:1)
H: 10.08.2006 19:00 R: 24.08.2006 19:00 Sieger: Hertha BSC
H IK Start - Drogheda United 1:0 (0:0)
R Drogheda United - IK Start 11:12 (0:0, 1:0, 1:0) i.E.
H: 10.08.2006 19:00 R: 24.08.2006 20:45 Sieger: IK Start
H Odense BK - Llanelli AFC 1:0 (1:0)
R Llanelli AFC - Odense BK 1:5 (1:2)
H: 10.08.2006 19:00 R: 24.08.2006 20:45 Sieger: Odense BK
H Randers FC - FBK Kaunas 3:1 (0:0)
R FBK Kaunas - Randers FC 1:0 (0:0)
H: 10.08.2006 19:00 R: 24.08.2006 18:00 Sieger: Randers FC
H SK Brann - Åtvidabergs FF 3:3 (2:1)
R Åtvidabergs FF - SK Brann 1:1 (1:0)
H: 10.08.2006 19:00 R: 24.08.2006 19:30 Sieger: Åtvidabergs FF
H Molde FK - Skonto FC 0:0 (0:0)
R Skonto FC - Molde FK 1:2 (0:1)
H: 10.08.2006 19:00 R: 24.08.2006 18:00 Sieger: Molde FK
H BSC Young Boys - Olympique Marseille 3:3 (1:2)
R Olympique Marseille - BSC Young Boys 0:0 (0:0)
H: 10.08.2006 19:30 R: 24.08.2006 20:45 Sieger: Olympique Marseille
H FC Twente - FC Levadia 1:1 (0:1)
R FC Levadia - FC Twente 1:0 (1:0)
H: 10.08.2006 19:30 R: 24.08.2006 20:00 Sieger: FC Levadia
H FK Ventspils - Newcastle United 0:1 (0:0)
R Newcastle United - FK Ventspils 0:0 (0:0)
H: 10.08.2006 19:50 R: 24.08.2006 20:45 Sieger: Newcastle United
H APOEL Nikosia - Trabzonspor 1:1 (1:0)
R Trabzonspor - APOEL Nikosia 1:0 (0:0)
H: 10.08.2006 20:00 R: 24.08.2006 19:45 Sieger: Trabzonspor
H Dinamo Bucureşti - Beitar Jerusalem 1:0 (0:0)
R Beitar Jerusalem - Dinamo Bucureşti 1:1 (1:1)
H: 10.08.2006 20:00 R: 24.08.2006 20:00 Sieger: Dinamo Bucureşti
H Partizan - NK Maribor 2:1 (2:0)
R NK Maribor - Partizan 1:1 (0:1)
H: 10.08.2006 20:00 R: 24.08.2006 21:00 Sieger: Partizan
H FK Sarajevo - Rapid Bucureşti 1:0 (0:0)
R Rapid Bucureşti - FK Sarajevo 2:0 (1:0)
H: 10.08.2006 20:00 R: 24.08.2006 18:30 Sieger: Rapid Bucureşti
H FC Fehérvár - Grasshopper Club Zürich 1:1 (0:0)
R Grasshopper Club Zürich - FC Fehérvár 2:0 (2:0)
H: 10.08.2006 20:00 R: 24.08.2006 19:30 Sieger: Grasshopper Club Zürich
H FC Basel - FC Vaduz 1:0 (0:0)
R FC Vaduz - FC Basel 2:1 (0:0)
H: 10.08.2006 20:00 R: 24.08.2006 19:30 Sieger: FC Basel
H FC Flora - Brøndby IF 0:0 (0:0)
R Brøndby IF - FC Flora 4:0 (0:0)
H: 10.08.2006 20:00 R: 24.08.2006 20:45 Sieger: Brøndby IF
H FK Sūduva - Club Brugge KV 0:2 (0:1)
R Club Brugge KV - FK Sūduva 5:2 (2:0)
H: 10.08.2006 20:00 R: 24.08.2006 20:30 Sieger: Club Brugge KV
H SV Mattersburg - Wisła Kraków 1:1 (1:1)
R Wisła Kraków - SV Mattersburg 1:0 (1:0)
H: 10.08.2006 20:45 R: 24.08.2006 20:30 Sieger: Wisła Kraków
H Gretna FC - Derry City 1:5 (1:1)
R Derry City - Gretna FC 2:2 (1:1)
H: 10.08.2006 20:45 R: 24.08.2006 20:30 Sieger: Derry City
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